為提升優質庫款支付服務及提高行政效率，本署提供下列服務措施：

一、電子化對帳服務：

（一）支用機關：本署全球資訊網支付作業查詢專區(另開新視窗)提供支用機關每日憑單支付對帳單、每月庫款支付對帳單及每月收支併列科目對帳單之查詢、列印及下載等對帳服務。

（二）受款商民：

1.電子郵件或傳真對帳服務：將庫款支付對帳資料以電子郵件或傳真等方式提供受款商民，便利受款商民即時核銷帳務。

2.網站對帳服務：受款商民可運用工商憑證、自然人憑證或健保卡(須先至中央健康保險署網站(另開新視窗)註冊並設定註冊密碼)，至本署全球資訊網「受款商民對帳專區」(另開新視窗)查詢庫款支付對帳資料，據以核銷帳務。

3.匯款附言欄服務：辦理庫款撥匯作業時，將付款憑單支出用途欄資料轉置於匯款附言欄，受款商民收到匯款時，可同時取得支出用途相關資訊，提升對帳時效。

二、網路申辦服務：支用機關可運用國庫電子支付系統申辦電子郵件信箱設定、員工薪津代扣款代繳及委託更正等20餘種服務，節省支用機關申請書表遞送（郵寄）成本。

三、電子郵件訊息主動通知服務：

（一）支用機關：系統自動將每日憑單支付對帳單、支用機關註冊憑證審核異動表、金融機構異動及匯款資料退匯等重要業務訊息，以電子郵件方式通知支用機關。

（二）受款商民：每日運用系統自動將金融機構異動訊息及申辦電子郵件(傳真)對帳服務處理結果等，以電子郵件方式通知受款商民。

四、設置服務窗口及專線：指派專人辦理快速支付案件及提供國庫支票註銷特別標識等服務；設置服務專線提供受款商民、金融機構、支用機關查詢款項支付情形，以及協助支用機關解決國庫電子支付相關作業問題等。